2013年，柯文哲在媒体上公布，他的儿子被确诊为阿斯伯格综合征，而他也是高度疑似患者。这并非偶然，柯文哲称自己从小“不会看人脸色、说话容易惹人白眼”。
最出名的是，2015年1月，柯文哲接待英国铁道贸易访问团时，受赠一枚怀表，当众称其为“破铜烂铁”，舆论一片哗然。
柯文哲的儿子柯傅尧在1996年被确诊为自闭症，当时仅有3岁。幸而在柯文哲的夫人、台北市联合医院妇幼院小儿科主治医生陈佩琪的支持下，父子俩都找到了快乐的生活方式。
柯傅尧2岁半时，陈佩琪发现儿子还不会说话，发音奇怪，叫妈妈是“啊啊”，叫爸爸是“哒哒”。查阅了大量资料，她发觉儿子有自闭症倾向。1996年，3岁的柯傅尧确诊了阿斯伯格综合征，属于自闭症谱系障碍的一种。
陈佩琪抱着一丝侥幸，把儿子送去了普通幼儿园，她想：“搞不好傅尧就是个普通孩子，过一两个礼拜，也许老师就会觉得他和其他孩子没什么两样。”
柯傅尧不会说话，整天就想去外面乱晃，哭哭闹闹，老师讲什么他都不听。按老师的话说，“他似乎不适合我们幼儿园”。
于是陈佩琪死了心，把儿子送到了台大医院儿童心智科的日间留院部康复。干预训练的7个月里，她见到了更多的自闭症孩子，很多比柯傅尧更为严重，她终于开始接受现实。白天她送儿子去康复，学习自闭症干预知识，晚上在家泛化。
陈佩琪没有强迫孩子说话，而是根据日常生活情境，不断描述他做的事情，灌输语言；教阿斯伯格综合征孩子技能，如洗澡，要列好明确的步骤，如先放冷水再放热水，洗头，抹洗发精……孩子喜欢读字卡，因而展示字卡时，可以放在自己眼旁，引导他对视等。
令她惊喜的是，柯傅尧4岁多终于开口说话，还非常流利，很快追上了同龄人。原来他其实是阿斯伯格，与典型自闭症不同，没有明显的语言和认知障碍，只是存在社交和沟通障碍，以及重复性刻板行为。
另一件让她欣慰的事是，幼儿园的园长同意让孩子入园。他们有特教经验，愿意在普通班级里融入一两个特殊需要孩子，这是他们要承担的社会责任。这次入园，陈佩琪去观察过，发现儿子在幼儿园表现不错，老师要求的事情都会配合，只是比其他孩子更沉默，喜欢自己玩耍。于是她放下心来。
